Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRIG1Q96JA1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms