Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms