Protein–RNA interactions for Protein: Q96I99

SUCLG2, Succinate--CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2Q96I99 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUCLG2Q96I99 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms