Protein–RNA interactions for Protein: Q96H15

TIMD4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMD4Q96H15 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms