Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BORCS6Q96GS4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms