Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MFSD3Q96ES6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms