Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms