Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FAF2Q96CS3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FAF2Q96CS3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FAF2Q96CS3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FAF2Q96CS3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FAF2Q96CS3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FAF2Q96CS3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FAF2Q96CS3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAF2Q96CS3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAF2Q96CS3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAF2Q96CS3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FAF2Q96CS3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAF2Q96CS3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAF2Q96CS3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAF2Q96CS3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAF2Q96CS3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAF2Q96CS3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAF2Q96CS3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAF2Q96CS3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FAF2Q96CS3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FAF2Q96CS3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAF2Q96CS3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAF2Q96CS3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms