Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ULK4Q96C45 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms