Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms