Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC59Q96AG4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC59Q96AG4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC59Q96AG4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC59Q96AG4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC59Q96AG4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC59Q96AG4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC59Q96AG4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC59Q96AG4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC59Q96AG4 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC59Q96AG4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC59Q96AG4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC59Q96AG4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC59Q96AG4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC59Q96AG4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC59Q96AG4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC59Q96AG4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC59Q96AG4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC59Q96AG4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC59Q96AG4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC59Q96AG4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC59Q96AG4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC59Q96AG4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC59Q96AG4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC59Q96AG4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC59Q96AG4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC59Q96AG4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC59Q96AG4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC59Q96AG4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC59Q96AG4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC59Q96AG4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms