Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UTP4Q969X6 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms