Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCAMP4Q969E2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms