Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms