Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CSRNP3Q8WYN3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms