Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ0

HAVCR2, Hepatitis A virus cellular receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR2Q8TDQ0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HAVCR2Q8TDQ0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HAVCR2Q8TDQ0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms