Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATL2Q8NHH9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms