Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms