Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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