Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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ZNF439Q8NDP4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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ZNF439Q8NDP4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ZNF439Q8NDP4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ZNF439Q8NDP4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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ZNF439Q8NDP4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF439Q8NDP4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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