Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms