Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCL2Q8N4E4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCL2Q8N4E4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCL2Q8N4E4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCL2Q8N4E4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCL2Q8N4E4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCL2Q8N4E4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCL2Q8N4E4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCL2Q8N4E4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCL2Q8N4E4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCL2Q8N4E4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCL2Q8N4E4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL2Q8N4E4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL2Q8N4E4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL2Q8N4E4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL2Q8N4E4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL2Q8N4E4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL2Q8N4E4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL2Q8N4E4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL2Q8N4E4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL2Q8N4E4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL2Q8N4E4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL2Q8N4E4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL2Q8N4E4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL2Q8N4E4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL2Q8N4E4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL2Q8N4E4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL2Q8N4E4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL2Q8N4E4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL2Q8N4E4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL2Q8N4E4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL2Q8N4E4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL2Q8N4E4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL2Q8N4E4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL2Q8N4E4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCL2Q8N4E4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDCL2Q8N4E4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms