Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms