Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM48Q8IWZ4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRIM48Q8IWZ4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRIM48Q8IWZ4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms