Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNDC1Q76NI1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNDC1Q76NI1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms