Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q71RC1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q71RC1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q71RC1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q71RC1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q71RC1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q71RC1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q71RC1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q71RC1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q71RC1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q71RC1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q71RC1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q71RC1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q71RC1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q71RC1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q71RC1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q71RC1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q71RC1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q71RC1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q71RC1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q71RC1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q71RC1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q71RC1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q71RC1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q71RC1 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q71RC1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q71RC1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q71RC1 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q71RC1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q71RC1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q71RC1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q71RC1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q71RC1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q71RC1 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q71RC1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q71RC1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q71RC1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q71RC1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q71RC1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q71RC1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q71RC1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q71RC1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q71RC1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q71RC1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q71RC1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q71RC1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q71RC1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q71RC1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q71RC1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q71RC1 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q71RC1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q71RC1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q71RC1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q71RC1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q71RC1 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q71RC1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q71RC1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q71RC1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q71RC1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q71RC1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q71RC1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q71RC1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q71RC1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q71RC1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q71RC1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q71RC1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q71RC1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q71RC1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q71RC1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q71RC1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q71RC1 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q71RC1 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q71RC1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q71RC1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q71RC1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q71RC1 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q71RC1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q71RC1 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q71RC1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q71RC1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q71RC1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q71RC1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q71RC1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q71RC1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q71RC1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q71RC1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q71RC1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q71RC1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q71RC1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q71RC1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q71RC1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q71RC1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q71RC1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q71RC1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q71RC1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q71RC1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q71RC1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q71RC1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q71RC1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q71RC1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms