Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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USP34Q70CQ2 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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USP34Q70CQ2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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USP34Q70CQ2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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USP34Q70CQ2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP34Q70CQ2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
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