Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms