Protein–RNA interactions for Protein: Q6XD76

ASCL4, Achaete-scute homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL4Q6XD76 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms