Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms