Protein–RNA interactions for Protein: Q6U736

OPN5, Opsin-5, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN5Q6U736 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
OPN5Q6U736 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms