Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms