Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMOD2Q6P5Q4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms