Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 NUMA1-206ENST00000534971 878 ntTSL 25.7□□□□□ -1.53e-12■■■■■ 32.5
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PRPF8Q6P2Q9 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.72□□□□□ -2.131e-9■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.199e-7■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 FGFR1OP-203ENST00000476078 682 ntTSL 319.37■□□□□ 0.691e-9■■■■■ 32.5
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PRPF8Q6P2Q9 EIF2AK4-204ENST00000558743 581 ntTSL 26.92□□□□□ -1.32e-6■■■■■ 32.4
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PRPF8Q6P2Q9 USP10-214ENST00000567526 330 ntTSL 34.6□□□□□ -1.679e-8■■■■■ 32.4
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PRPF8Q6P2Q9 NPEPPS-215ENST00000530173 2864 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.356e-9■■■■■ 32.4
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PRPF8Q6P2Q9 TTN-AS1-241ENST00000591332 528 ntTSL 54.39□□□□□ -1.712e-6■■■■■ 32.4
PRPF8Q6P2Q9 XPOT-203ENST00000538086 787 ntTSL 51.13□□□□□ -2.239e-10■■■■■ 32.4
PRPF8Q6P2Q9 PSMD13-214ENST00000534590 787 ntTSL 58.65□□□□□ -1.022e-7■■■■■ 32.4
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PRPF8Q6P2Q9 SUPT7L-201ENST00000337768 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.245e-7■■■■■ 32.4
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PRPF8Q6P2Q9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.274e-18■■■■■ 32.4
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PRPF8Q6P2Q9 YWHAZ-216ENST00000521309 1399 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.94e-18■■■■■ 32.4
PRPF8Q6P2Q9 YWHAZ-207ENST00000395958 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.924e-18■■■■■ 32.4
PRPF8Q6P2Q9 YWHAZ-202ENST00000395948 812 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.224e-18■■■■■ 32.4
PRPF8Q6P2Q9 YWHAZ-212ENST00000480304 2247 ntTSL 27.4□□□□□ -1.224e-18■■■■■ 32.4
PRPF8Q6P2Q9 YWHAZ-218ENST00000521607 750 ntTSL 33.14□□□□□ -1.914e-18■■■■■ 32.4
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PRPF8Q6P2Q9 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.064e-18■■■■■ 32.4
PRPF8Q6P2Q9 NRDE2-205ENST00000556189 2937 ntTSL 1 (best)8.84□□□□□ -0.993e-8■■■■■ 32.3
PRPF8Q6P2Q9 NRDE2-202ENST00000553409 3434 ntTSL 1 (best)8.28□□□□□ -1.083e-8■■■■■ 32.3
PRPF8Q6P2Q9 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.553e-8■■■■■ 32.3
PRPF8Q6P2Q9 AP000311.1-201ENST00000429238 1078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.036e-7■■■■■ 32.3
PRPF8Q6P2Q9 HECTD1-209ENST00000555311 503 ntTSL 35.18□□□□□ -1.587e-14■■■■■ 32.3
PRPF8Q6P2Q9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.271e-8■■■■■ 32.3
PRPF8Q6P2Q9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.231e-8■■■■■ 32.3
PRPF8Q6P2Q9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.141e-8■■■■■ 32.3
PRPF8Q6P2Q9 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.461e-8■■■■■ 32.3
PRPF8Q6P2Q9 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.521e-8■■■■■ 32.3
PRPF8Q6P2Q9 HIGD1A-205ENST00000470543 983 ntTSL 211.21□□□□□ -0.621e-8■■■■■ 32.3
PRPF8Q6P2Q9 AC099329.1-201ENST00000625589 539 ntTSL 55.08□□□□□ -1.61e-8■■■■■ 32.3
PRPF8Q6P2Q9 NUDCD3-202ENST00000355451 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.773e-7■■■■■ 32.3
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