Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms