Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms