Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms