Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACHD1Q5VU97 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACHD1Q5VU97 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACHD1Q5VU97 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACHD1Q5VU97 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACHD1Q5VU97 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
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CACHD1Q5VU97 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CACHD1Q5VU97 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACHD1Q5VU97 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACHD1Q5VU97 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACHD1Q5VU97 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACHD1Q5VU97 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CACHD1Q5VU97 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CACHD1Q5VU97 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACHD1Q5VU97 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACHD1Q5VU97 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CACHD1Q5VU97 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACHD1Q5VU97 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACHD1Q5VU97 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACHD1Q5VU97 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACHD1Q5VU97 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACHD1Q5VU97 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACHD1Q5VU97 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACHD1Q5VU97 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACHD1Q5VU97 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACHD1Q5VU97 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACHD1Q5VU97 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACHD1Q5VU97 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACHD1Q5VU97 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACHD1Q5VU97 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACHD1Q5VU97 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACHD1Q5VU97 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACHD1Q5VU97 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACHD1Q5VU97 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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