Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 LRTM1-201ENST00000273286 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms