Protein–RNA interactions for Protein: Q5TH69

ARFGEF3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF3Q5TH69 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGEF3Q5TH69 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms