Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEND3Q5T5X7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms