Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms