Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms