Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC93Q567U6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms