Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RNF212Q495C1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RNF212Q495C1 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RNF212Q495C1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RNF212Q495C1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RNF212Q495C1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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RNF212Q495C1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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RNF212Q495C1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF212Q495C1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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