Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP13-3Q3SY46 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms