Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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KRTAP21-1Q3LI58 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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