Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms