Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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CTF1Q16619 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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CTF1Q16619 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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CTF1Q16619 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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CTF1Q16619 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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CTF1Q16619 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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CTF1Q16619 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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