Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms